Cudowna podróż to magiczna opowieść o losach niesfornego czternastoletniego chłopca Nilsa Holgerssona. Pewnego dnia, gdy chłopiec nie chciał iść z rodzicami do kościoła, ojciec nakazał mu lekturę Pisma Świętego. Jednak niepokorny Nils nie zamierzał wykonać polecenia, zamiast tego postanowił przeszukać starą skrzynię. Odnalazł w niej elfa, którego chciał uwięzić w siatce na motyle, wówczas elf zamienił go w stworzenie jego wzrostu. I od tego momentu rozpoczyna się niezwykła przygoda Nilsa. Zwierzęta, które wcześniej dręczył, chcą się na nim zemścić, pomocną dłoń wyciągnął jedynie gąsior o imieniu Marcin, który zabrał go w niezwykłą podróż, w trakcie której chłopiec poznaje Szwecję…