Fabuła Blackhole skupia się na przygodach załogi statku kosmicznego Endera, który rozbija się na znajdującym się w czarnej dziurze obiekcie o nazwie Entity, zbliżonym w swojej formie do planety. Pierwszy z ocalałych rozbitków przy pomocy zaawansowanej sztucznej inteligencji musi nie tylko naprawić szkody wyrządzone przez kolizję i ocalić swoich kolegów, ale także zniszczyć od środka czarną dziurę, która zagraża Ziemi.